- •Міністерство освіти і науки України
- •Програма
- •Професор кафедри біоінформатики, д.Ф-м.Н., проф. Горобець о.Ю. _______________
- •Мета та завдання навчальної дисципліни
- •Рекомендований розподіл навчального часу
- •Тема 1. Основні алгоритми біоінформатики.
- •Тема 2. Методи динамічного програмування
- •4. Рекомендована тематика лабораторних робіт (комп’ютерних практикумів)
- •5. Рекомендовані індивідуальні завдання
- •6. Рекомендована література
- •8. Методичні рекомендації
Мета та завдання навчальної дисципліни
1.1. Метою навчальної дисципліни є формування у студентів здатностей:
до вивчення принципів роботи та визначення можливостей використання біоінформаційних методів аналізу порівняння складу, структури та властивостей і взаємодії різних біологічних молекул;
до використання сучасних інформаційних та обчислювальних технологій для підтримки і оновлення баз даних молекулярної біології.
логічно мислити, вирішувати складні проблеми з молекулярної біології з використанням сучасного програмного забезпечення та оволодіння навичками користувача світових баз даних для вирішення задач генетики, мікробіології, медицини та ін.
Згідно з вимогами програми навчальної дисципліни студенти після засвоєння кредитного модуля мають продемонструвати такі результати навчання:
знання :
набуття знань та навичок з оцінки можливостей та практичного використання біоінформаційних баз даних в дослідженнях з молекулярної біології;
уміння:
набуття умінь у написання комп’ютерних програм для побудови різноманітних вирівнювань.
отримання умінь і навичок роботи з основними наявними нуклеотидними ресурсами біоінформаційних баз даних і, як наслідок, вмінь проведення аналізу геномів, виділення з їх складу окремих генів, екзон-інтронної структури окремих нуклеотидних послідовностей, сигнальних послідовностей і т. ін.;
набуття умінь і навичок роботи з основними наявними білковими ресурсами біоінформаційних баз даних і, як наслідок, вмінь проведення аналізу амінокислотних послідовностей, оцінювання ролі окремих складових амінокислотної послідовності у функціонуванні білка, передбачення вторинної та третинної структури білка за її лінійною будовою і т. ін.
набуття умінь і навичок роботи з використання програмних продуктів основних БІБД: GenBank, EMBL, SwissProt, PDB, методу розпізнавання фолда і т. ін.
досвід:
в процесі вивчення дисципліни студенти отримують досвід у написанні програм на мові програмування Ruby та роботи з різними базами даних, а також в майбутньому зможуть аналізувати та працювати в різних базах даних, вивчивши основи їх ієрархії та організації.
2. На вивчення навчальної дисципліни відводиться 108 годин/ 3 кредита ECTS.
Навчальна дисципліна містить 1 кредитний модуль.
Рекомендований розподіл навчального часу
Форма
навчання
Кредитні модулі
Всього
кредитів
Години
Розподіл навчального часу за видами занять
Семестрова
атестація
Лекції
Практичні
(семінарські) заняття
Комп’ютерні практикуми
СРС
Денна
Всього
3
108
26
-
26
56
1
3
108
26
-
26
56
залік
Заочна
1
3
108
4
-
4
100
залік
Семестровий (кредитний) модуль 1. (з розподілом на розділи)
Розділ 1. Основи курсу.