ВЫВОДЫ

1.У молочнокислых бактерий Lactobacillus plantarum NRRL B-4496 и Pediococcus pentosaceus NRRL B-11465 обнаружена сходная структура локуса утилизации сахарозы: дивергентно расположенные ген scrA, кодирующий сахарозоспецифичный второй фермент фосфотрансферазной системы, и гены scrB, scrR и agl, кодирующие β-фруктозидазу, регуляторный белок и α-глюкозидазу

соответственно. Сходство 5′-концевых частей генов scrB у L. plantarum и

P.pentosaceus достигает 98.6%.

2.Проведено картирование в субтеломерных районах хромосом Saccharomyces cerevisiae девяти полимерных генов ферментации мелибиозы: ген MEL2 локализован в левом плече седьмой хромосомы (VII L), MEL3 – в XVI L, MEL4 –

в XI L, MEL5 – в IV L, MEL6 – в XIII R, MEL7 – в VI R, MEL8 – в XV R, MEL9 – в

XR и MEL10 – в XII R.

3.У штамма S. cerevisiae CBS 2888 обнаружено три гена ферментации мелибиозы MEL12-MEL14, представляющие новое дивергентное семейство α-галактозидазных генов. Проведено картирование этих генов в субтеломерных районах левых плечей хромосом S. cerevisiae: MEL12 в – IX, MEL13 – в XV и

MEL14 – в X.

4.Обнаружена закономерность локализации полимерных генов семейств утилизации углеводов у S. cerevisiae. Гены ферментации сахарозы, мальтозы и мелибиозы, принадлежащие одному семейству (SUC, MAL, MEL1-MEL11 или MEL12-MEL14), никогда не находятся в противоположных концах одной и той же хромосомы (даже в разных штаммах).

5.Обнаружена гомология аминокислотных последовательностей β-фруктозидаз, принадлежащих двум разным семействам гликозил-гидролаз: GH32 и GH68. Эти два семейства объединены в β-фруктозидазное суперсемейство.

6.Обнаружена гомология белков β-фруктозидазного суперсемейства с β-D-ксилозидазами и α-L-арабинофуранозидазами семейств GH43 и GH62 гликозил-гидролаз. Оба семейства включены в состав β-фруктозидазного суперсемейства. В состав этого суперсемейства также включена группа гипотетических белков, вероятно, кодирующих гликозидазы.

СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Статьи:

1.Naumoff D.G. β-fructosidase superfamily: homology with some α-L-arabinases and β-D-xylosidases // Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2001, V. 42, P. 66-76.

2.Наумов Д.Г. и Лившиц В.А. Молекулярная структура локуса утилизации сахарозы

Lactobacillus plantarum: сравнение с Pediococcus pentosaceus // Молекулярная биология, 2001,

т. 35, No1, стр. 19-27.

3.Naumoff D.G. Conserved sequence motifs in levansucrases and bifunctional β-xylosidases and α-L-arabinases // FEBS Letters, 1999, V. 448, P. 177-179.

4.Наумов Д.Г. Гомологичный локус геномов Bacillus subtilis и Bacillus stearothermophilus,

содержащий гены левансахаразы и леваназы // Молекулярная биология, 1999, т. 33, Nо2,

стр. 207-210.

5.Naumoff D.G. Levanase gene sequence from strain Bacillus sp. L7 (letter) // FEMS Microbiology Letters, 1998, V. 164, P. 227-228.

6.Наумов Д.Г. и Дорошенко В.Г. β-фруктозидазы: новое суперсемейство гликозил-гидролаз // Молекулярная биология, 1998, т. 32, Nо5, стр. 902-907.

7.Наумов Г.И. и Наумов Д.Г. Генетическое картирование нового дивергентного семейства α-галактозидазных генов MEL у дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Биотехнология, 1997, Nо1, стр. 26-28.

8.Наумов Г.И. и Наумов Д.Г. Суперсемейство α-галактозидазных генов MEL у дрожжей

Saccharomyces cerevisiae // Доклады АН, 1997, т. 353, Nо3, стр. 426-429.

9.Наумов Г.И., Наумов Д.Г. и Луис Э.Д. Локализация семейства α-галактозидазных генов MEL в правых и левых теломерах дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Доклады АН, 1995, т. 341, Nо1,

стр. 134-136.

Тезисы конференций:

10.Наумов Д.Г. Новое суперсемейство гликозил-гидролаз: β-фруктозидазы гомологичны β-ксилозидазам и α-L-арабиназам // Материалы конференции “Биосфера и человечество”, 20-21 сентября 2000, Обнинск, стр. 116-122.

11.Naumoff D.G. Enzymes of fructan synthesis and degradation: sequence analysis and classification // Abstracts of 4th International Fructan Symposium “Fructan 2000”, August 16-20, 2000, Arolla, Switzerland, P. 1.4.

12.Наумов Д.Г. и Лившиц В.А. Сравнительный анализ систем утилизации сахарозы молочнокислых бактерий Lactobacillus plantarum и Pediococcus pentosaceus // Тезисы школы-конференции “Горизонты физико-химической биологии”, 28 мая – 2 июня 2000, Пущино, т. 2, стр. 130.

13.Наумов Д.Г. Новое суперсемейство гликозил-гидролаз: β-фруктозидазы генетически родственны β-ксилозидазам и α-L-арабиназам // Тезисы докладов II съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров. 1-5 февраля 2000, Санкт-Петербург, т. 2, стр. 231-232.

14.Наумов Д.Г., Дорошенко В.Г. и Лившиц В.А. Секвенирование фрагмента гена сахаразы из Lactobacillus plantarum (Тезисы стендовых сообщений конференции, посвящённой 30-летию журнала “Молекулярная биология”, 17-19 декабря 1997, Москва) // Молекулярная биология, 1998, т. 32, Nо2, стр. 373.

15.Наумов Д.Г., Дорошенко В.Г. и Лившиц В.А. Секвенирование гена сахаразы из Lactobacillus plantarum // Тезисы V научной конференции ГосНИИгенетика, 28-31 октября 1997, стр. 23.

16.Наумов Д.Г. Генетическое картирование суперсемейства α-галактозидазных генов MEL дрожжей Saccharomyces cerevisiae в теломерах // Тезисы IV научной конференции ГосНИИгенетика, 22-26 апреля 1996, стр. 21.