Кровеносная система
У большинства видов брюшная аорта в самом начале имеет вздутие — артериальную луковицу. Внешне она похожа на артериальный конус, но состоит не из поперечнополосатой, а из гладкой мускулатуры и не способна к состоятельному пульсированию. Число приносящих и выносящих жаберных артерий (артериальных дуг) равно четырем. Вперед от корней аорты отходят сонные артерии, снабжающие кровью головной мозг. Корни аорты соединены анастомозом и образуют характерный для костных рыб головной круг. Для венозной системы большинства видов характерна непрерывность правой кардинальной вены; только левая кардинальная вена образует в соответствующей почке воротную систему кровообращения. Количество крови, содержание гемоглобина и ее кислородная емкость варьирует в широких пределах у разных видов рыб в зависимости от их подвижности.
Нервная система и органы чувств
Головной мозг костных рыб по ряду признаков имеет более примитивное строение по сравнению с хрящевыми. Его общие размеры относительно меньше, особенно мал передний мозг; крыша переднего мозга у большинства видов эпителиальная и не содержит нервного вещества. Впереди видны обонятельные доли. Боковые желудочки не разделены даже неполной перегородкой (как это свойственно хрящевым рыбам). Промежуточный мозг, средний и мозжечок, наоборот, относительно увеличены. Имеется 10 пар черепно-мозговых нервов.
Орган зрения имеет типичное для рыб строение: плоскую роговицу и круглый хрусталик. Фокусировка осуществляется у них исключительно хрусталиком — в покое он обеспечивает близкую видимость, для дальнего зрения специальной мышцей он смещается слегка в глубь глазного яблока, т. е. аккомодация глаза у рыб достаточно примитивна. Костистые рыбы имеют цветное зрение. В их сетчатке наравне функционируют палочки и колбочки. Видимо, этим обусловлено и удивительное богатство окраски покровов многих костистых рыб. Правда, глубоководные формы, как и акулы, имеют только палочковое (неокрашенное) зрение.
Орган слуха у костистых рыб представлен внутренним ухом — перепончатым лабиринтом. Он воспринимает звуки в широком диапазоне — 30 Гц — 12 кГц. В восприятии звуков им помогают уже упомянутые плавательный пузырь и веберов аппарат. В воспроизводстве звуков у них участвуют подвижные жаберные крышки, кости головы, движение плавников. Как выяснилось, рыбы чрезвычайно «говорливы». Звуковая сигнализация обеспечивает связь особей одного и разных видов при разыскивании корма, половых контактах, для оповещения о врагах, о занятости удобного участка. Звуки, издаваемые рыбами, разнообразны: цоканье, шепот, скрип, Щелчки, трели, стоны и т.д.Во внутреннем ухе расположен еще один из органов чувств — орган равновесия. Чувство равновесия обеспечивается тремя полукружными каналами, наполненными жидкостью с плавающими в ней твердыми включениями. Чувство равновесия — одно из самых древних чувств позвоночных животных.
Органы обоняния. У большинства костистых рыб органы обоняния представлены парными обонятельными мешками, расположенными в передней верхней части головы. Полость каждого обонятельного мешка сообщается с водной средой двумя (передним и задним) отверстиями. Вода прогоняется через них, а в складках обонятельного мешка происходит химическая рецепция. С ротовой полостью у костистых рыб обонятельный мешок не сообщается.
Органы вкуса. Органы вкуса представлены вкусовыми почками, состоящими из групп клеток, оплетенных окончаниями нервов. Вкусовые почки расположены не только в ротовой полости, но и разбросаны по многим участкам тела в наружном слое кожи.
Органы боковой линии. Органы боковой линии представляют собой длинные каналы, лежащие в коже по бокам тела рыбы. Спереди на голове они образуют сложную сеть каналов. Чувствующие клетки лежат на дне этих каналов, а с окружающей средой они сообщаются множественными отверстиями в чешуе и костях головы. Эти видимые отверстия обычно и называются органами боковой линии.Органами боковой линии рыба воспринимает волновые движения, распространяющиеся в воде и информирующие рыбу о предметах, находящихся вблизи от нее.