Разное / Все лекции
.pdf
Шифр (индекс) ферментов
В соответствии с международной классификацией и принятыми в 1972 г. «Правилами номенклатуры ферментов» каждому ферменту присвоен четырехзначный классификационный номер, включающий класс, подкласс, подподкласс и порядковый номер в подподклассе. Перед четырѐхзначным шифром ставятся буквы КФ (классификатор ферментов) или ЕС (Enzyme classification)
См. слайд № 12
Шифр ферментов
класс 1 – оксидоредуктаза
подкласс 1 – дегидрирует гидроксильную группу
вподподклассе 1 –
валфавитном порядке первый
подподкласс 1 – акцептором водорода является НАД+
1.1.1.1. – шифр фермента алкогольдегидрогеназы
|
|
|
|
|
O |
|
СН2ОН |
|
|
СН2О |
P OH |
|
|
|
|
OO |
|
|
O |
|
|
|
|
|
OH |
+ АТФ |
гексокиназа |
OH |
+ АДФ |
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
HO |
OH |
|
|
HO |
OH |
|
OH |
|
|
|
OH |
глюкоза |
|
|
глюкозо-6-фосфат |
||
ЕС 2. 7. 1. 1
класс 2 – |
подподкласс 1 – |
трансфераза |
акцептором фосфата |
|
является ОН-группа |
подкласс 7 – |
|
перенос фосфата |
|
D-гексозо-6-фосфотрансфераза
Регуляция скорости ферментативных реакций
1. Количеством ферментов 
2.Доступностью фермента и субстрата
3.Регуляцией активности самого фермента:
•компонентами самой клетки
•аллостерическая
•химическая модификация
•частичный протеолиз
Регуляция скорости ферментативных реакций
компонентами самой клетки – температурой, рН, количеством субстрата, компартментализацией (расположением в определѐнных «компартментах» – отделах клетки
– цитозоле, митоходриях и т.д.) ферментов, наличием эффекторов
Аллостерическая
регуляция
Аллостерическая регуляция. Многие ферменты наряду с активным имеют дополнительный аллостерический центр (греч. άλλες – иной, другой), к которому присоединяется не субстрат, а эффектор – активатор или ингибитор. Этот центр называют также регуляторным, а ферменты, обладающие таким центром – аллостерическими, или регуляторными, ферментами. Обычно аллостерические ферменты построены из двух и более субъединиц: одни субъединицы содержат каталитический центр, другие имеют аллостерический центр и являются регуляторными. Присоединение эффектора к аллостерическому центру регуляторной субъединицы изменяет конформацию белка и, соответственно, активность каталитической субъединицы
Аллостерическая
регуляция
субстрат
Аллостерический
центр
Активный центр
активатор |
ингибитор |
|
Аллостерическая
регуляция
+
А Е1 
В Е2 
С Е3 
D Е4 
F Е5 
ПР
В качестве аллостерических эффекторов часто выступают компоненты биохимических процессов – исходные вещества и продукты реакций (поэтому аллостерическую регуляцию часто называют «саморегуляцией»). Аллостерические ферменты обычно катализирует одну из начальных стадий, например, в процессе окисления глюкозы – гликолизе, протекающем в зависимости от условий в 10 или 11 стадий, регуляторным ферментом является фосфофруктокиназа, катализирующая третью реакцию.
Регуляция активности фермента 
путем фосфорилирования/ дефосфорилирования
Фосфорилирование и дефосфорилирование (ковалентная модификация) – один из наиболее распространѐнных способов регуляции активности ферментов. Такая модификация заключается в обратимом присоединении или отщеплении фосфорной кислоты. Фосфорилирование фермента происходит по остаткам серина и тирозина. Присоединение фосфорной кислоты к белку осуществляют ферменты протеинкиназы,
отщепление – протеинфосфатазы.
Ферменты могут быть активны как в фосфорилированном, так и в дефосфорилированном состоянии. Например, при фосфорилировании ферментов, участвующих в обмене гликогена, фермент распада гликогена (гликогенфосфорилаза) находится в активном состоянии, а фермент синтеза гликогена (гликогенсинтаза) – в неактивном. В дефосфорилированном состоянии, наоборот, гликогенфосфорилаза неактивна, а гликогенсинтаза активна. 
Регуляция путѐм ассоциации-диссоциации
Активация путѐм диссоциации-ассоциации характерная для олигомерных ферментов, состоящих из каталитических и регуляторных субъединиц. В отсутствии активатора субъединицы соединены таким образом, что каталитические протомеры не могут проявлять свою активность. Появление активатора приводит к диссоциации олигомера и активации фермента, при отщеплении модификатора регуляторные и каталитические субъединицы вновь объединяются (ассоциируют) в неактивный комплекс. Такая модификация не является ковалентной.
Процессы диссоциации-ассоциации и фосфорилирования- дефосфорили-рования не происходят спонтанно, а начинаются только при поступлении гормонального сигнала.