Разное / Все лекции
.pdf
По механизму действия
1.Коферменты с высоким потенциалом переноса энергии (переносчики энергии);
2.Коферменты, участвующие в окислительно-восстановительных реакциях;
3.Коферменты, формирующие активный центр фермента.
Классификация ферментов
В 1961 г. в Москве V Международный биохимический союз принял современную классификацию. В основу классификации положен тип химической реакции, катализируемой ферментом. В соответствии с этой классификацией все ферменты делятся:
•на классы – по типу катализируемой реакции;
•каждый класс подразделяется на подклассы – по природе атакуемой химической группы;
•подклассы делятся на подподклассы – по характеру атакуемой связи или по природе акцептора.
Классификация ферментов 
1.Оксидоредуктазы – ферменты, катализирующие
окислительно-восстановительные реакции, лежащие в основе биологического окисления. К оксидоредуктазам относятся дегидрогеназы, оксидазы, моно- и диоксигеназы, пероксидазы. Этот класс насчитывает 22 подкласса.
А |
|
Н2 + В |
|
|
А + В |
|
Н2 |
|
|
|
|||||
|
|
||||||
|
|
|
|
2. Трансферазы – ферменты, катализирующие
межмолекулярный перенос атомов или функциональных групп (т.е. от донора к акцептору):
В классе трансфераз девять подклассов в зависимости от типа переносимой группы (аминотрансферазы, ацилтрансферазы, метилтрансферазы и т.д.)
3. Гидролазы – ферменты, осуществляющие реакции гидролиза, т.е. реакции расщепления химической связи с присоединением воды в ионной форме по месту разрыва:
А В + Н2О 
А Н + В ОН
В классе гидролаз 13 подклассов, различающихся по типу
гидролизуемой связи – пептидазы, фосфатазы, эстеразы (гидролизуют сложноэфирные связи), гликозидазы и т.д.
4. Лиазы – ферменты, катализирующие негидролитический разрыв химических связей (С О, С С, C N и других связей). Эти реакции могут сопровождаться образованием двойной связи или присоединением групп к месту двойной связи. Включает семь подклассов.
А В + а-в |
|
А |
|
В |
|
|
|||
|
а в
5. Изомеразы катализируют реакции изомеризации,
взаимопревращения оптических и геометрических изомеров, а также внутримолекулярный перенос групп (в этом случае они называются также «мутазы»). Существует пять подклассов изомераз.
цис
транс, D
L
6. Лигазы (синтетазы) – ферменты, катализирующие
присоединение друг к другу двух молекул с использованием энергии высокоэнергетических связей АТФ (или других нуклеозидтрифосфатов):
А + В + АТФ |
|
А В + НР + АДФ |
|
В 2018 году было предложено ввести новый,
седьмой класс ферментов – транслоказы.
Причиной стало то, что ни один из принятых классов не может описать группу ферментов, катализирующих движение ионов или молекул через мембраны, или их разделение внутри мембран. Некоторые из этих ферментов связаны с гидролизом АТФ и ранее классифицировались как АТФазы (ЕС 3.6.3.х), хотя гидролитическая реакция не является их основной функцией.
класс |
под- |
катализируемая |
|
|
класс |
|
реакция |
1.оксидоредуктазы |
|
Гидрогенизация и |
|
|
|
дегидрогенизация |
|
|
1.1 |
СН |
OH |
|
1.2 |
H |
|
|
С |
O |
|
|
1.3 |
СН |
СН |
|
|
||
|
1.4 |
СН |
NH2 |
|
1.5 |
H |
|
|
СН |
NН |
|
|
|
H |
|
|
1.6 |
НАДН, НАДФН |
|
класс |
под- |
катализируемая реакция |
|
класс |
|
2.транс- |
|
перенос функциональных |
феразы |
|
групп |
2.1Одноуглеродных групп
2.2Альдегидной или кетогруппы
2.3Ацила
2.4Гликозила
2.5Алкильной (но не метила) или арильной группы
2.6Азотсодержащей группы
2.7Фосфатсодержащей группы
2.8Серосодержащей группы
класс |
под- |
катализируемая реакция |
|
класс |
|
|
|
|
3.гидролазы |
|
гидролитические реакции |
|
|
|
|
3.1 |
Сложных эфиров |
|
|
|
|
3.2 |
Гликозидов |
|
|
|
|
3.3 |
Простых эфиров |
|
|
|
|
3.4 |
Пептидов |
|
|
|
|
3.5 |
Других С—N-связей |
|
|
|
|
3.6 |
Ангидридов кислот |
|
|
|
Номенклатура ферментов 
Для ферментов принято несколько типов названий – систематическое (в соответствии с международной классификацией), рабочее (более простое и удобное), тривиальное.
•Так систематическое название фермента, катализирующего дегидрирование глутаминовой кислоты – L-глутамат: NADоксидоредуктаза (рабочее – глутаматдегидрогеназа).
•Рабочее название фермента в большинстве случаев содержит суффикс «аза», присоединѐнный к названию субстрата (амилаза, уреаза, липаза) или к названию субстрата и типу реакции, катализируемой ферментом (аденилатциклаза, глутаматдегидрогеназа, гликогенфосфорилаза).
•Наряду с этими основными названиями используются также и тривиальные, исторически устоявшиеся названия, не дающие представления ни о субстрате, ни о типе катализируемой реакции
– пепсин, трипсин, тромбин, плазмин и т.д.