Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

2 курс / Микробиология 1 кафедра / Доп. материалы / Биохимические_и_генетические_особенности_реализации_патогенности

.pdf
Скачиваний:
0
Добавлен:
24.03.2024
Размер:
4.97 Mб
Скачать

181

143.Gilchrist, C. A., Turner, S. D., Riley, M. F., Petri, W. A. Jr, Hewlett, E. L. Whole-Genome Sequencing in Outbreak Analysis // ClinMicrobiol Rev. 2015. Vol. 28 № 3. P. 541-563.

144.Carvalhais, V., França, A., Cerca, F., Vitorino, R., Pier, G. B., Vilanova, M., Cerca, N. Dormancy within Staphylococcus epidermidis

biofilms: a transcriptomic analysis by RNA-seq // ApplMicrobiolBiotechnol.

2014. Vol. 98. № 6. P. 2585-2596.

145.França, A., Carvalhais, V., Maira-Litrán, T., Vilanova, M., Cerca, N.,

Pier, G. Alterations in the Staphylococcus epidermidis biofilm transcriptome

following interaction with whole human blood // PathogDis. 2014. Vol. 70.

3. P. 444-448.

146.Carvalhais, V., França, A., Pier, G. B., Vilanova, M., Cerca, N.,

Vitorino, R. Comparative proteomic and transcriptomic profile of

Staphylococcus epidermidis biofilms grown in glucose-enriched medium //

Talanta. 2015. Vol. 132. P.705-712.

147.Cordwell, S. J., Larsen, M. R., Cole, R. T., Walsh, B. J.Comparative proteomics of Staphylococcus aureus and the response of methicillinresistant and methicillin-sensitive strains to Triton X-100 // Microbiology. 2002. Vol. 148. № 9. P. 2765-2781.

148.Nandakumar, R., Nandakumar, M. P., Marten, M. R., Ross, J. M. Proteome analysis of membrane and cell wall associated proteins from

Staphylococcus aureus // J Proteome Res. 2005. Vol. 4 № 2. P. 250-257.

149.Resch, A., Leicht, S., Saric, M., Pásztor, L., Jakob, A., Götz, F., Nordheim, A. Comparative proteome analysis of Staphylococcus aureus biofilm and planktonic cells and correlation with transcriptome profiling // Proteomics. 2006. Vol. 6. № 6. P. 1867-1877.

150.Picotti, P., Bodenmiller, B., Mueller, L. N., Domon, B., Aebersold, R. Full dynamic range proteome analysis of S. cerevisiae by targeted proteomics // Cell. 2009. Vol. 138. № 4. P. 795-806.

Рекомендовано к изучению разделом по микробиологии сайта https://meduniver.com/

182

151.Solis, N., Parker, B. L., Kwong, S. M., Robinson, G., Firth, N., Cordwell, S. J. Staphylococcus aureus surface proteins involved in adaptation to oxacillin identified using a novel cell shaving approach // J Proteome Res. 2014. Vol. 13. № 6. P. 2954-2972.

152.Islam, N., Kim, Y., Ross, J. M., Marten, M. R. Proteomic analysis of

Staphylococcus aureus biofilm cells grown under physiologically relevant

fluid shear stress conditions // Proteome Sci. 2014. Vol. 12. P. 21.

153.McFarland, J. Nephelometer; an instrument for estimating the number of bacteria in suspensions used for calculating the opsonic index and for vaccines // Journal of American Medical Association. 1907. Vol. 14. P. 11761178.

154.Sambrook, J., Fritsch, E. F., Maniatis, T. Molecular cloning: a laboratory manual, 2nd ed. // Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.

155.Воронина, О. Л., Кунда, М. С., Дмитренко ,О. А., Лунин, В. Г., Гинцбург, А. Л. Разработка схемы мультилокусного секвенирования // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2011. Т. 5. С. 62-67.

156.

GenBank®

.[Электронный

ресурс].

URL:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank

157.Basic Local Alignment Search Tool. [Электронный ресурс]. URL: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

158.Molecular Evolutionary Genetics Analysis. [Электронный ресурс]. URL: http://www.megasoftware.net

159.eBURST: inferring patterns of evolutionary descent among clusters of related bacterial genotypes from multilocus sequence typing data.

[Электронный ресурс]. URL: http://eburst.mlst.net/v3/enter_data/single/

160.Sequence Type Analysis and Recombinational Tests Version 2.

[Электронный ресурс]. URL: http://pubmlst.org/software/analysis/start2/

183

161.Hunter, P. R., Gaston, M. A. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity // J Clin Microbiol. 1988. Vol. 26. № 11. P. 2465-2466.

162.van Belkum, A., Tassios, P. T., Dijkshoorn, L., Haeggman, S., Cookson, B., Fry, N. K., Fussing, V., Green, J., Feil, E., Gerner-Smidt, P., Brisse, S., Struelens, M. Guidelines for the validation and application of typing methods for use in bacterial epidemiology // Clin Microbiol Infect. 2007. Vol. 13. P. 1-46.

163.Pathosystems Resourse Integration Center. [Электронный ресурс]. URL: https://www.patricbrc.org/portal/portal/patric/Home

164.The virulence factor database. [Электронный ресурс]. URL: www.mgc.ac.cn/VFs/

165.

Virulence

factor.

[Электронный

ресурс].

URL:

www.phidias.us/victors/

166.SUPERFAMILY. [Электронный ресурс]. URL: http://supfam.org/SUPERFAMILY/index.html

167.Остерман, Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: Электрофорез и ультрацентрифугирование (практическое пособие) // Наука. 1981. C. 288.

168.PSORTdbt. [Электронный ресурс]. URL: http://db.psort.org/

169. DOGAN

[Электронный

ресурс].

URL:

http://www.bio.nite.go.jp/dogan/ortholog/view/

170.Miragaia, M., Thomas, J. C., Couto, I., Enright, M. C., de Lencastre, H. Inferring a Population Structure for Staphylococcus epidermidis from Multilocus Sequence Typing Data // Journal of Bacteriology. 2007. Vol. 189.

№ 6. P. 2540–2552.

171.Craft, A., Finer, N. Nosocomial coagulase negative staphylococcal (CoNS) catheter-related sepsis in preterm infants: definition, diagnosis, prophylaxis, and prevention // J. Perinatol. 2001. Vol. 26. P. 186-192.

Рекомендовано к изучению разделом по микробиологии сайта https://meduniver.com/

184

172.Bansal, S., Jain, A., Agarwal, J., Malik, G. K. Significance of coagulase negative staphylococci in neonates with late onset septicemia // Indian J Pathol Microbiol. 2004. Vol. 47. P. 586-588.

173.Lazarevic, V., Soldo, B., Düsterhöft, A., Hilbert, H., Mauël, C., Karamata, D. Introns and intein coding sequence in the ribonucleotide reductase genes of Bacillus subtilis temperate bacteriophage SPbeta // Proc Natl Acad Sci U S A. 1998. Vol. 95. № 4. P. 1692-1697.

174.Deghorain, M., Bobay, L. M., Smeesters, P. R., Bousbata, S., Vermeersch, M., Perez-Morga, D., Dreze, P. A., Rocha, E. P., Touchon, M., Van Melderen, L. Characterization of novel phages isolated in coagulase-

negative

staphylococci

reveals

evolutionary

relationships

with Staphylococcus aureus phages //J. Bacteriol. 2012. Vol. 194. P. 5829–

5839.

175.Sugai, M., Fujiwara, T., Akiyama, T., Ohara, M., Komatsuzawa, H., Inoue, S, Suginaka, H. Purification and molecular characterization of glycylglycine endopeptidase produced by Staphylococcus capitis EPK1 //J Bacteriol. 1997. Vol. 179. № 4. P. 1193-1202.

176.Łoś, M., Węgrzyn, G. Pseudolysogeny // Adv Virus Res. 2012. Vol. 82 P. 339-349.

177.Kutter, E., Kellenberger, E., Carlson, K., Eddy, S., Neitzel, J., Messinger, L., North, J., Guttman, B. Effects of bacterial growth condition and physiology on T4 infection / In ‘‘Molecular Biology of Bacteriophage T4’’ (J. D. Karam, ed.) // American Society for Microbiology. 1994. P. 406–

418.

178.Los, M., Wegrzyn, G., Neubauer, P. A role for bacteriophage T4 rI gene function in the control of phage development during pseudolysogeny and in slowly growing host cells // Res Microbiol. 2003. Vol.154. № 8. P. 547-552.

179.Grice, E. A., Kong, H. H., Conlan, S., Deming, C. B., Davis, J.,

185

Young, A. C., NISC Comparative Sequencing Program, Bouffard, G. G., Blakesley R. W., Murray P. R., Green, E. D., Turner, M. L., Segre, J.A. Topographical and temporal diversity of the human skin microbiome // Science. 2009. Vol. 324. P. 1190-1192.

180.al-Salem, A.H., Qaisaruddin, S., Qureshi, S.S. Perianal abscess and fistulain ano in infancy and childhood: a clinicopathological study // Pediatr Pathol Lab Med. 1996. Vol. 16. № 5. P. 755-764.

181.Koukourakis, M. I., Giatromanolaki, A., Sivridis, E., Gatter, K.C., Trarbach, T., Folprecht, G., et al. Prognostic and predictive role of lactate dehydrogenase 5 expression in colorectal cancer patients treated with PTK787/ZK 222584 (vatalanib) antiangiogenic therapy // Clin Cancer Res.

2011. Vol. 17. № 14. P. 4892-4900.

182.Chan, F. K., Moriwaki, K., De Rosa, M. J. Detection of necrosis by release of lactate dehydrogenase activity // Methods Mol Biol. 2013. Vol. 979. P. 65-70.

183.Yang, Z., Bielawski, J. P. Statistical methods for detecting molecular adaptation // Trends Ecol Evol. 2000. Vol. 15. P. 496–503.

184.Корниенко, М. А., Ильина, Е. Н., Боровская, А. Д., Эдельштейн, М. В., Сухорукова, М. В., Кострцева, М., Говорун, В. М. Штаммовая классификация Staphylococcus aureus посредством прямого масс-

спектрометрического профилирования // Биомедицинская химия. 2012.

Т. 58. № 5. С. 501-513.

185.Arnold, R. J., Reilly, J. P. Fingerprint matching of E. coli strains with matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry of whole cells using a modified correlation approach // Rapid Commun Mass Spectrom. 1998. Vol. 12. № 10. P. 630-636.

186.The Universal Protein Resource. [Электронный ресурс]. URL: http://www.uniprot.org/

187.Jeong, S.T., Kim, H.K., Kim, S.J., Pan, J.G., Oh, T.K., Ryu, S.E.

Рекомендовано к изучению разделом по микробиологии сайта https://meduniver.com/

186

Crystallization and preliminary X-ray analysis of a thermoalkalophilic lipase

from Bacillus stearothermophilus L1 // Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.

2001. V. 57. № 9. Р. 1300-1302.