- •1. Основные представления о микробиологических средах и их компонентах
- •1.1. Классификация сред, терминология
- •1.2. Питательные основы
- •1.3. Агар-агар и его заменители
- •1.4. Сыворотка крови животных и человека
- •1.5. Твины
- •1.6. Минеральные соли
- •1.7. Селективные агенты Красители
- •2. Грамотрицательные аэробы 2.1. Род Псевдомонады
- •2.2. Сем. Нейссерии
- •2.3. Род Бордетеллы
- •2.4. Род Бруцеллы
- •4.3. Сем. Пастереллы Род Пастереллы
- •8.4. Род бациллы
- •8.5. Род микобактерий
ВВЕДЕНИЕ
УДК 619:576.8 ББК48.4Р 13
Печатается по постановлению Редакционно-издательского совета АНТ
Рецензенты: зав. кафедрой микробиологии Казанского государственного университета, докт. биол. наук, профессор, дейст-вит. член АН Республики Татарстан И. Б. Лещинская; зав. кафедрой микробиологии Казанской государственной академии ветеринарной медицины, докт. ветер, наук, профессор Р. Г. Госманов.
Равилов А. 3., Гильмутдинов Р. Я., Хусаинов М. Ш.
МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ СРЕДЫ. Казань: Фэн, 1999.-398 с.
В книге проанализированы микробиологические среды и использование их в различных областях биологии, медицины и ветеринарии как в нашей стране, так и за рубежом. Особое внимание уделено наиболее часто используемым компонентам микробиологических сред, информация о которых относительно слабо освещена в современной литературе. Приводятся сведения о современных средах, анализируются их достоинства и недостатки, рассматривается история изучения вопроса. Максимально полно исследован вопрос использования сред при работе с такими инфекционными агентами, как энтеробактерии, микобактерии, микоплазмы, стрепто- и стафилококки, грибы.
Книга рассчитана на практических врачей и научных сотрудников ветеринарного и медицинского профиля, работающих в области микробиологии, микологии и инфекционной патологии, а также специалистов гос.-сан. эпидемиологической службы, пищевой и микробиологической промышленности.
Конструирование и производство качественных стандартных питательных сред—одна из важнейших проблем биотехнологии, медицинской и ветеринарной микробиологии (Смирнова Г. А., 1991).
Несмотря на успехи, достигнутые в борьбе с инфекционными болезнями, уровни заболеваемости в мире остаются высокими: появляются новые болезни; отмечается возвращение старых, которые считались практически искорененными. В Латинской Америке участились случаи холеры, в России—резко увеличилось число заболевших дифтерией. Наблюдается распространение болезней Лайме, легионеров, синдрома токсического шока и других (Ecologist, 1995). В структуре причин смертей в Европе инфекционные болезни занимают 3-е место, уступая лишь сердечно-сосудистой патологии и онкологическим заболеваниям. В США при ранжировании причин смертей инфекционные болезни вышли на 4-е место. Успешная борьба с инфекциями возможна лишь при условии истинности диагноза и хорошо налаженного эпидемиологического надзора с использованием широкого спектра лабораторных методов. Система эпид. надзора предполагает обязательное применение данных микробиологических исследований (Покровский В. И. и соавт., 1995).
По информации ВОЗ ежегодно в мире острые кишечные инфекции (ОКИ) переносят 2 млрд. человек. Этиологическая структура ОКИ в разных странах существенно разнится. Так, в Великобритании 1-е место среди бактериальных ОКИ занимает кам-пилобактериоз, во многих странах Европы—сальмонеллезы, в Японии—заболевания, вызываемые парагемолитическим вибрионом. В России же из более чем 5 млн. случаев ОКИ, зарегистрированных за последние 10 лет, этиология половины (55,6%) не установлена. Из расшифрованных—1-е место принадлежит ши-геллезам. Широко распространенный кампилобактериоз диагностируется плохо из-за отсутствия необходимого лабораторного оборудования и недостаточного знакомства медработников с методами выделения микроаэрофильных бактерий.
За последние 10 лет отмечена тенденция роста заболеваемости чумой в мире, с ежегодным темпом прироста на 12,5%, что связано с активацией эпидемиологического процесса в Африке. В Азии эта цифра составляет 18,5%. Последняя вспышка в Индии выявила неподготовленность органов здравоохранения. Эпидемиологическую ситуацию по России следует считать неустойчивой в связи с наличием возбудителя чумы в его резервуарах и опасностью завоза из-за границы (Мишанькин Б. Н. и соавт., 1995).
Поданным ВОЗ 1/3 населения мира заражена М. tuberculosis,aSchultzeG. (1992) считает, что показатель инфицированности населения мира туберкулезом достигает 50%. Ежегодно регист-
ISBN 5-7544-0137-Х
© Издательство «Фэн». 1999
3
рируется 8—10 млн. случаев туберкулеза и 3—4 млн. человек умирают. Стало увеличиваться число случаев туберкулеза в европейских странах. В США с 1988 по 1993 годы туберкулез у детей возрос на 40%, преимущественно за счет городского контингента.
В системе Гос. сан.-эпид. надзора РФ потребителями микробиологических сред являются лаборатории бактериологические и особо опасных инфекций. 1-ые занимаются идентификацией возбудителей пищевых отравлений и воздушно-капельных инфекций, а 2-ые—возбудителей бруцеллеза, чумы, листериоза, ле-гионеллеза, туляремии, лептоспироза, туляремии, сибирской язвы, холеры и бореллиоза. Используются среды при исследовании фармацевтического сырья, антибиотиков, витаминов и косметических средств; питьевых, промышленных и сточных вод; молока и молочных продуктов; мяса и мясных продуктов, яиц, хлебобулочных изделий и напитков.
Потребителями сред для микобактерий является противотуберкулезная служба МЗ РФ, а среды для культивирования возбудителей сифилиса, гонореи и кожных заболеваний (грибы) применяются в учреждениях дермато-венерологического профиля.
Крупномасштабно используются питательные среды в микробиологической промышленности для культивирования патогенных микроорганизмов с целью изготовления вакцин, а также при культивировании микроорганизмов—продуцентов ценных биологически активных продуктов.
К сожалению, даже в относительно благополучные времена существования СССР ассортимент выпускаемых у нас питательных сред намного уступал таковому ведущих зарубежных стран: США, ФРГ, Великобритании (Смирнова Г. А., Муравьева В. А., 1984). В связи с напряженной эпидемиологической обстановкой в Российской Федерации (увеличение заболеваемости дифтерией, туберкулезом, сифилисом, природно-очаговыми и зооноз-ными инфекциями; высокий уровень заболеваемости коклюшем, дизентерией, брюшным тифом, сальмонеллезом, гонореей и внутрибольничными инфекциями), одной из основных задач Министерства здравоохранения является расширение ассортимента и совершенствование качества питательных сред (Они-шенко Г. Г., 1997).
После разрушения системы централизованного обеспечения микробиологическими средами образовавшуюся нишу достаточно активно и успешно заполнило большое количество фирм, представительств и предприятий, специализирующихся как на их производстве и реализации, так и на чисто посреднических функциях. При этом цены и качество реализуемой продукции зачастую значительно варьируют. Достаточно активно внедряются на наш рынок иностранные компании из США, Англии, Франции, Испании, Германии, Индии и других стран. Между тем, положение потребителей затрудняется отсутствием полной информации об этих организациях и их продукции.
Определенные трудности испытывают сотрудники научно-исследовательских учреждений и ВУЗов при изготовлении микробиологических сред в связи с дефицитом многих компонентов тех или иных рецептур, обилием самих рецептур и в целом, с отсутствием обобщающего современного анализа этих вопросов.
Учитывая изложенное, мы в представленной работе попытались обобщить литературу по микробиологическим средам, в основном за последние 10—15 лет.
1. Основные представления о микробиологических средах и их компонентах
1.1. Классификация сред, терминология
Большинство существующих классификаций сред достаточно условно и не всегда обосновано, что отмечается и самими авторами (Семенов С. М., 1990 и др.).
По составу микробиологические среды подразделяются на естественные (натуральные), искусственные (полусинтетические) и синтетические (Блинов Н. П. и соавт., 1988; Семенов С. М., 1990). Однако Федоров Р. В. (1990), характеризуя состав сред, использует термины «безбелковые», «белковые» и «минеральные», а деление на естественные и искусственные, на его взгляд, это классификацияпо происхождению.
По консистенции среды могут быть жидкими (бульоны), полужидкими (с добавлением 0,3—0,7% агара), полуплотными, плотными (1,5—2% агара), а также, по классификации Блинова Н. П. и соавт. (1988),сыпучими и сухими. Сыпучие среды используют для хранения посевного материала, культур-продуцентов в микробиологической и медицинской промышленности. Это разваренное пшено и кварцевый песок, пропитанный питательным раствором. Сухие среды представляют собой гигроскопические порошки или гранулы с влажностью до 10%. Гранулированная форма имеет ряд преимуществ по сравнению с порошкообразной: при работе с ней образуется меньше мелкодисперсной пыли, которая может вызвать аллергические реакции; кроме того, гранулы не прилипают к стенкам сосудов, облегчая, тем самым, взятие навесок; быстро пропитываются водой и образуют растворы, не содержащие комочков (Подунова Л. Г. и соавт., 1996). Часто используются в качестве синонимов термины «твердые», «полутвердые», «мягкие». В некоторых случаях для уплотнения сред применяется желатин (10—15%) и силикагель. Ряд естественных питательных сред (свернутые сыворотка крови, яичный белок) сами по себе являются плотными (Борисов Л. Б. и соавт., 1993).
4
5
По целевому назначениюсреды делятся наосновные (питательные основы), элективные и дифференциально-диагностические (Борисов Л. Б. и соавт., 1993). Лабинская А. С. (1978) подразделяет среды по этому принципу на общего назначения и специальные, относя к последним элективные (избирательные) и дифференциально-диагностические. Под средами общего назначения фактически рассматриваются питательные основы: мя-со-пептонный агар (МПА), мясо-пептонный бульон (МПБ) и др. В то же время Федоров Р. В. (1990), опираясь на данный критерий, выделяет среды обычные или простые, специальные или элективные и дифференциально-диагностические. Таким образом, дифференциально-диагностические среды по непонятным, во всяком случае для нас, соображениям выделяются им из специальных сред в самостоятельную группу. Семенов С. М. (1990) по назначению среды разделяет на дифференциально-диагностические, элективные, накопительные (обогащения, накопления), ингибиторные, селективные, индикаторные и консервирующие (транспортные).
Виестур У. Э. и соавт. (1980) классифицируют питательные среды по назначению на диагностические и производственные. Первые предназначены в основном для обнаружения, выделения и идентификации патогенных микроорганизмов по морфологическим и биохимическим признакам и, в свою очередь, делятся на элективные, обогатительные, консервирующие и дифференциально-диагностические. Производственные среды подразделяются по составу на посевные и основные ферментационные, приготовленные в большинстве случаев на полупродуктах и отходах сельскохозяйственного и пищевого производства с добавками минеральных солей.
Требования к производственным средам: максимальный выход продукции (в частности, токсинов и др.) и бактериальной массы, дешевизна. Проблемой является загрязнение бактериальной массы компонентами культуральной среды, в частности белками сыворотки крови, вынуждающее использовать многократное отмывание и концентрирование.
На наш взгляд, по целевому назначению среды можно было бы классифицировать как культуральные, дифференциально-диагностические, производственные испециальные.
Пяткин К. Д., Кривошеий Ю. С. (1981), Блинов Н. П. и соавт. (1988) подразделяют среды на 4 группы: универсальные (обычные или простые, по терминологии Блинова Н. П. и соавт., 1988) специальные, избирательные (элективные) и дифференциально-диагностические. При этом «универсальные» (по терминологии Пяткина К. Д., Кривошеина Ю. С., 1981) и «основные» (по терминологии Борисова Л. Б. и соавт., 1993) среды фактически представляют собой одну и ту же группу.
В «Руководстве по микробиологии, клинике и эпидемиологии инфекционных болезней (М., 1962) диагностические среды
б
делятся на консервирующие, обогащения, элективные и дифференциально-диагностические.
В более позднем «Руководстве по микробиологической диагностике инфекционных болезней» (М., 1973) среды делятся на 3 группы: 1. для культивирования, включающие универсальные простые, сложные специальные и для токсинообразования;2. для выделения и накопления, включающие среды консервирующие, накопления и элективные; 3. для идентификации, включающие дифференциальные и элективно-дифференциальные.
Дифференциально-диагностические среды—предназначены для разграничения отдельных видов или групп микроорганизмов. Принцип их построения основан на видовом различии в биохимической активности бактерий вследствие неодинакового набора ферментов (Борисов Л. Б. и соавт., 1993), а также по культуральным свойствам (Пяткин К. Д., Кривошеий Ю. С, 1981). В состав этих сред входят: питательная основа, обеспечивающая размножение бактерий; определенный углевод, различное отношение к которому является диагностическим признаком данного вида бактерии; цветной индикатор рН (например, индикатор Андреде), свидетельствующий о сдвиге рН в кислую сторону вследствие ферментации соответствующего углевода (Борисов Л. Б. и соавт., 1993). К ним относят среды для определения протеолитической, гемолитической и восстановительной (редуцирующей) способностей микробов, ферментации углеводов, а также среды, содержащие вещества ассимилируемые только определенными микробами.
К группе дифференциально-диагностических относят и селективные среды, предназначенные для дифференциации про-то- и ауксотрофных бактерий (Пяткин К. Д., Кривошеий Ю. С, 1981).
Рекомендуется 5 критериев для оценки селективных сред MosselD. (1986).Продуктивность—соотношение между количеством колоний выделяемого вида бактерий, выросших на селективной среде с и без селективных агентов.Селективность— соотношение между количеством колоний ингибируемых видов бактерий выросших на селективной среде с и без селективных агентов.Дифференциабельность (элективность)— способность легко различать на селективной среде колонии разных видов бактерий.Действенность—выделение при использовании данной селективной среды из образцов искомых видов бактерий и ингибирование сопутствующих.Систематическая необъективность—пределы, в которых использование данной селективной среды ограничивает выделение из образцов того или иного вида бактерий или биотипа искомой группы, или вида бактерий.
В универсальном варианте селективная среда должна удовлетворять следующим требованиям: обеспечивать рост 100% штаммов конкретного вида микроорганизма, даже при наличии еди-
7
ничных клеток в пробе; полностью подавлять рост любых видов сопутствующей микрофлоры; не изменять видовые свойства исследуемого микроорганизма; быть простой в изготовлении и не содержать дефицитных или дорогостоящих компонентов (Рожа-вин М. А., Бугаева Е. И., 1986).
Элективными называются среды для избирательного выделения и накопления микроорганизмов определенного вида или группы из материалов, содержащих разнообразную постороннюю микрофлору. При создании этих сред исходят из биологических особенностей конкретных микроорганизмов, отличающих их от большинства других. Например, избирательный рост стафилококков наблюдается при повышенной концентрацииNaCl, холерного вибриона—в щелочной среде и т. д. (Борисов Л. Б. и соавт., 1993). К ним относятся среды обогащения (накопления,enrichment), в которых интересующий исследователя вид растет интенсивнее и быстрее сопутствующей микрофлоры (Пят-кин К. Д., Кривошеий Ю. С, 1981). В свою очередь, Калина Г. П., Комзолова Н. Б. (1988) в обзоре, касающемсяPs.aeruginosa, подразделяют среды накопления на неселективные и инги-биторные.
Специальные среды—предназначены для выращивания бактерий, не размножающихся на «универсальных» («основных») средах. К ним относятся кровяной агар, сывороточные агар и бульон и др. Как специальные, очевидно, можно рассматривать ивосстановительные среды, а также среды для определения антибиоти-кочувствительности микроорганизмов. К последним относятся агар АГВ (НПО «Питательные среды», Махачкала) и его зарубежные аналоги—агары Мюллера-Хинтона и ИзоСенситест. Ксожалению переход в ближайшем будущем микробиологических лабораторий нашей страны к использованию агара Мюллера-Хинтона, в соответствии с наиболее часто применяемыми в международной практике стандартами Национального комитета по клиническим и лабораторным стандартам США (NCCLS) не представляется возможным (Козлов Р. С. и соавт., 1996).
Краткую инструкцию по классификации питательных сред, значению отдельных ингредиентов, входящих в них, их приготовлению и хранению предлагает KreuzerК. (1994).